根据《协议》，科技部将在有关的科技计划中安排与绿色建筑技术、建筑节地、节水、节能、节材和环保技术相关的科研项目，并与建设部共同组织实施，研究开发一批拥有自主知识产权的关键技术，完善技术体系，提高绿色建筑技术水平。
建设部和科技部还将共同组织编制适合中国不同气候区、不同类型建筑的绿色建筑技术导则和评估体系，制定技术经济政策，指导和规范绿色建筑的发展。
双方将开展绿色建筑科技示范工程，在北京、上海等城市实施100项绿色建筑科技示范工程。
建设部将与科技部联合组织开展绿色建筑技术标准研究，计划“十一五”期间修订200项国家标准和行业标准。科技部将支持建设部组建工程技术研究中心、重点实验室等，整合科技资源，增强创新能力，为绿色建筑技术发展和科技成果产业化奠定基础。双方还将每年共同组织召开国际绿色建筑大会及有关技术研讨会，开展国际交流。
